Nuevas medidas que forman parte de la estrategia de prevención de contagios durante los Juegos se sumarán a otras ya anunciadas por la organización, como el aislamiento dentro de las instalaciones y la restricción de los movimientos de las personas, según consta en la segunda versión de la Guía para Atletas. Estos desplazamientos se permitirán sólo entre la villa olímpica o los hoteles y los lugares de competencia. Quienes lleguen a la captal nipona durante los Juegos tendrán prohibido el turismo y la asistencia a cualquier lugar que no sea la sede asignada para cada deporte o función específica. Misma medida rige para dirigentes, los que fueron reducidos al máximo posible en cada federación. Ellos tampoco tendrán libre circulación, y tendrán además que hacer una cuarentena de catorce días luego de arribar a Tokio o alguna otra ciudad sede, en el caso del fútbol.
Deportistas, equipos técnicos y acompañantes de las delegaciones deberán someterse a dos test antes de viajar desde sus respectivos países hacia Japón. Las medidas sanitarias se han extremado en las últimas semanas, tras registrarse un aumento global del virus y el primer contagio durante el relevo de la antorcha. Así Tokio 2020 se restringe cada vez más de manera de reducir los riesgos de una cancelación definitiva por rebrote del virus.